当晚兵马进城，清点损失之后，刘牢之痛心不已。两万兵马的前锋军攻一座小小的愕寻阳城，阵亡了两千多人，伤者数千。这样的损失让刘牢之难以接受。虽然攻下了寻阳城，军令状的事算是过去了，但是代价也太大了。关键是，这还仅仅是开始。
思索之后，刘牢之觉自己不能再这么被消耗下去。他向王珣提出了兵马于寻阳休整的要求。兵马死伤太过惨重，需在寻阳休整，请求令派兵马顶替前军的位置往前进攻。
王珣毫无余地的拒绝了刘牢之的要求，命令刘牢之的兵马继续沿江突进，前往夏口。要刘牢之务必扫清前往夏口的通道，以便大军主力随后抵达，攻占夏口。
刘牢之大骂不已，却也不敢违抗军令。但他已经认定王珣在公报私仇，在自己的兵马损失如此巨大的情况下，既不补充兵员，又不允许休整，这显然是要将自己的兵马当炮灰了。
这种情形下，刘牢之只能将怒火埋在心底，下令兵马继续往西，为后续主力兵马开路。
寻阳之战看似平平无，但其实意义很大。对朝廷大军而言，攻下浔阳郡，便有了西进的兵力物资和港口的基地。浔阳城距离夏口不过四百里，攻占此处，便是牢牢的站稳了脚跟，给后续进攻确定了锚点。
借着寻阳城的辐射，左翼司马尚之的兵马也以安然突进。寻阳城攻克之后的第三日，司马尚之率领一万五千兵马兵临豫章城下。至此，展开了全面攻占江州的态势和格局。
而对于桓玄而言。桓谦并没有将豫州兵马撤到夏口，而是神来一笔的来到了寻阳。虽然最终没能守住，但却成功的拖延了前后五六天的时间。这对桓玄大军而言是极为宝贵的五六天的时间。
当刘牢之不不继续率军西进，朝廷大军随后挺进的时候，桓玄大军从江陵乘船顺流而下，仅仅数日，三万六千大军便全部抵达江夏，完成了集结。
四月十三，刘牢之攻克沿江几县之后抵达夏口。四月十六，王珣率中军四万余抵达。双方完成了军力的集结。
