十月初七，在经过了长达两个多月的准备之后，谢玄终于下达了渡过黄河，进攻邺城的命令。
尽管后军清淤河道之事未能完成，但好消息是，今年秋冬河道枯水的情况并不明显，往年秋季干燥的情形并未发生。故而后勤物资粮草的补给并没有受到严重的影响。大批的物资粮草从水陆两路源源不断的运抵坊头，包括大量的攻城器械在内的大量军备物资堆满了黄河南岸的坊头大营。
尽管谢安派人送来了亲笔信，对谢玄决定要渡河攻击邺城的举动表示了隐约的担忧。
谢安在信中也告诉谢玄，西路梁州刺史杨亮已经于八月中完全收复梁州，至此西路大军完成了收复梁益二州，收复襄阳以及荆襄以北的几处郡县。
朝廷不久前召开了廷议，认为在东西两路兵马都取极大进展的情况下，北伐已经取了很好的成果的情况下，北伐应该到此为止。
原因很简单，本次北伐之前本就只是进行有限的进攻，而非为了收复全部北方之地。囿于兵马实力等因素，当适可而止，免过犹不及。另外，东西北伐大军消耗的粮草物资甚巨，朝廷已经难以供应了。
从去年开始的三吴内涝的影响一直延续到今年，今年夏天，三吴之地经历了六七场飓风暴雨天气，造成了极大的损失。两年内涝的叠加，导致了连续两年粮食的减产。三吴之地出现了流民难民，这着实罕见。在这种情况下，再连续的支撑两只大军北伐是不可能的。
谢安在信上说，北府军的粮食物资的调运已经遭到了朝廷之中许多人的质疑。有人已经强烈建议北府军撤军，将粮食物资用来赈济今冬必然发生的饥荒。这种时候，继续进攻并不恰当。
